3D打印、手術(shù)導航,層出不窮的醫(yī)工結(jié)合新技術(shù)為臨床疾病的診斷和治療提供了輔助和指導作用。伴隨大數(shù)據(jù)的賦能,醫(yī)工結(jié)合逐漸在罕見病領(lǐng)域展現(xiàn)出其獨特的優(yōu)勢。神經(jīng)系統(tǒng)罕見病大多數(shù)為基因突變導致的遺傳病,且患者分型尚不明確、具體,臨床治療工作與預(yù)后的預(yù)測仍然存在困難。醫(yī)工結(jié)合將會如何在此過程中“大展身手”?
在2022年中國罕見病大會分論壇十“神經(jīng)系統(tǒng)罕見病前沿研究與進展”現(xiàn)場,來自北京協(xié)和醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科的戴毅教授與我們分享了醫(yī)工結(jié)合背景下Duchenne型肌營養(yǎng)不良(DMD)和脊髓性肌萎縮癥(SMA)的診療進展。
戴毅教授作為中國罕見病聯(lián)盟DMD/BMD學組組長,TREAT-NMD遺傳性神經(jīng)肌肉病國際患者數(shù)據(jù)庫中國負責人,參與建立國際標準化DMD患者數(shù)據(jù)庫,多次參加相關(guān)國際會議,并且在中國罕見病聯(lián)盟成立DMD/BMD罕見病專家工作室,截止目前,戴毅教授專家工作室已建立284個患者精準群,精準管理數(shù)千位DMD/BMD患者。
戴教授指出,在經(jīng)過循證醫(yī)學時代后,我們已經(jīng)走進了對病人進行細分、對患者給予針對性、個體化治療方案的精準醫(yī)學時代?;蛉毕菪院币姴【哂胁∫蛎鞔_、診斷的指向性高,患者同質(zhì)性高、患者群體數(shù)量少的特點,滿足進行個體化醫(yī)療的條件。
1 數(shù)據(jù)庫助力表型劃分
DMD是最常見的肌營養(yǎng)不良類型,為由同一基因受累引起的X染色體連鎖隱性遺傳病,在活產(chǎn)男嬰中發(fā)病率約為1/3300-1/6000,是一種發(fā)病率較高的罕見病。
傳統(tǒng)的疾病表型經(jīng)二分法劃分為較輕的Becker型(BMD)與較重的DMD,并認為由同一致病基因引起的兩種疾病表型在治療方式上存在差異。這一種劃分方法簡單便捷,但臨床上卻有許多患者的疾病進展介于BMD與DMD之間,且同一分型的患者也存在癥狀的異質(zhì)性。由于BMD患者癥狀較輕、生存年限長,患者疾病受累輕重的差異更加明顯。傳統(tǒng)的二分法顯然已經(jīng)不適用于如今DMD患者的確診、預(yù)后的評估與治療。
隨著患者量的積累與大數(shù)據(jù)的賦能,基于中國國家罕見病注冊系統(tǒng)的高數(shù)據(jù)量數(shù)據(jù)庫可以發(fā)現(xiàn)DMD患者存在著如下譜系:BMD、BMD-IMD、IMD、IMD-DMD和DMD。有些DMD基因存在一定缺陷的患者甚至可以表現(xiàn)出完全正常的功能活動,這一現(xiàn)象為臨床專家認識DMD的疾病機制提供了更多提示。
個體化醫(yī)療要求對于疾病進行精準分型,從而能夠基于不同病情的患者制定個性化的診療方案,同時還能協(xié)助醫(yī)生更客觀地交代病情,利于家屬理解疾病并做好準備,為致病基因攜帶者提供遺傳咨詢、指導產(chǎn)前診斷。個性化的診療方案十分重要,戴教授介紹在精準醫(yī)療時代以前,有些BMD患者即使表型較輕,但由于診療過程缺乏對于個體疾病進展的認知,往往很小年齡就開始使用激素,給患者帶來弊大于利的副作用。
2 大數(shù)據(jù)賦能分子診斷
DMD的致病基因雖然單一、明確,但導致疾病的基因突變類型確是多種多樣的,突變類型的不同能夠直接反映在疾病的表型上,其中基因大片段缺失導致DMD在患者中占比最多。
針對于這一類型疾病的系統(tǒng)研究始于1988,研究人員著手對DMD基因不同片段的缺失與疾病的輕重之間的關(guān)聯(lián)進行探究。美國哈佛醫(yī)學院的研究團隊提出了讀碼框理論,這是最早對單基因遺傳病的致病機制進行詮釋的專業(yè)理論。
近年來,隨著患者量的積累,逐漸出現(xiàn)了少部分不符合讀碼框理論的病例,即20%的患者雖然存在著打亂的讀碼框卻貢獻輕型表型。隨著患者數(shù)據(jù)量的積累與基因檢測技術(shù)的發(fā)展,科研人員闡述了人體對疾病的代償機制,繼而對讀碼框理論進行了補充。
蛋白質(zhì)翻譯水平代償
數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn),打亂讀碼框卻貢獻輕型表型的患者主要存在外顯子3-7的缺失。隨著基因測序水平的提高,有研究團隊發(fā)現(xiàn)這種患者存在著通過微小突變提前終止翻譯前段mRNA,而在外顯子8重新開始翻譯一段截短的蛋白質(zhì)。在基因診斷更加明確后,科學家們也觀察到當外顯子2缺失,或外顯子1、2出現(xiàn)微小無義突變時,細胞也可以從外顯子6重新開始翻譯,使患者獲得截短的蛋白質(zhì),繼而代償生理功能。
轉(zhuǎn)錄剪切水平代償
當靠后節(jié)段的密碼子出現(xiàn)突變時,由于重要功能域的缺失,即使mRNA重新翻譯出截短的蛋白質(zhì),也不能行使生理功能。這種情況下患者會出現(xiàn)新的代償機制。戴教授為我們介紹患者31-43外顯子缺失一例,這種情況下雖然出現(xiàn)了讀碼框的打亂,但在轉(zhuǎn)錄水平上由于外顯子44的自發(fā)跳躍而補全了部分讀碼框。這種患者雖然不能出現(xiàn)類似BMD的輕癥,但表現(xiàn)為較輕的DMD。對基因序列的深入了解也讓人們更加認識人體的自發(fā)代償機制。
3 生信技術(shù)提供預(yù)后新提示
另外,在數(shù)據(jù)庫中也有部分患者DMD基因沒有打亂讀碼框,卻表現(xiàn)出較重的表型,戴教授也對這一現(xiàn)象做出了解釋:
一方面,由于DMD/BMD學組數(shù)據(jù)庫中部分數(shù)據(jù)來源于個人數(shù)據(jù)庫,由醫(yī)生個人上傳,這一過程中可能存在表型判斷的主觀偏差,這也提示了數(shù)據(jù)庫表型分類還需進一步系統(tǒng)性規(guī)范;
另一方面,通過體外實驗和算法預(yù)測,科研團隊發(fā)現(xiàn)DMD基因可能出現(xiàn)拼接障礙繼而形成假外顯子導致更重的疾病表型。
體外實驗和生物信息學方法,將致病基因的突變從外顯子水平精確至堿基水平,能夠指導預(yù)測假外顯子的產(chǎn)生。這也提示我們,可以通過綜合核磁共振等檢查方法,綜合判斷患者疾病進展,繼而幫助臨床更精確地評估患者的預(yù)后。
4 見微知著,以基因型預(yù)測疾病進展
SMA是一種常染色體隱性遺傳病,戴教授以此為例介紹了通過精準探測基因型預(yù)測疾病表型、繼而找到最優(yōu)干預(yù)時機、最大限度提高患者預(yù)后的方法。SMA常常累及神經(jīng)系統(tǒng)的損害,而這一種功能損傷往往是不可逆的,即最佳的治療時機是在患者出現(xiàn)癥狀以前。
如何能在疾病出現(xiàn)癥狀之前就進行干預(yù)呢?這就要求我們做到廣泛的基因篩查。美國85%的嬰兒在出生即進行篩查,若存在疾病的風險,即在出生后6周之內(nèi)給予患兒第一次治療。
臨床試驗結(jié)果呈現(xiàn)出早期干預(yù)患兒更好的預(yù)后,但這一措施仍然存在一定的缺陷,有些患兒雖然存在著基因的突變,但可能終身不表現(xiàn)出重癥。這種情況下,出生后6周之內(nèi)即進行干預(yù)可能不是最優(yōu)解,提示我們還需要進一步找到最佳干預(yù)時機。
如何基于基因序列獲得更準確具體的疾病表型,如何依據(jù)新生兒和核苷酸序列預(yù)測幾十年后的疾病進展,這是目前存在的挑戰(zhàn)。我們相信,隨著醫(yī)學技術(shù)與人工智能、大數(shù)據(jù)技術(shù)的深度結(jié)合與發(fā)展,將會更加增益于更精準地找到疾病干預(yù)窗口、更大限度地提高患者的生存質(zhì)量。
5 五大MDT管理模式,助力罕見病診療
早在2019年10月,SMA疾病的一款修正藥物在中國剛剛上市,北京協(xié)和醫(yī)院SMA-MDT團隊便完成了對成年患者的鞘內(nèi)注射。在2021年中國罕見病大會上,戴毅教授曾分享了SMA多學科會診的“協(xié)和經(jīng)驗”,介紹了北京協(xié)和醫(yī)院探索出的罕見病MDT診療“五大模式”。
一次性院級多學科診療
優(yōu)點在于科室齊全,前期準備充分,全面高效。但聚齊院內(nèi)各學科專家機會難得,服務(wù)的患者就相對有限。戴毅教授指出,這種方式適用于全面了解某種罕見病、組建院級MDT架構(gòu)并多科室正在共同探索某種罕見病診療新技術(shù)的情況,或適用于某些難以確診的疑難病例。
多學科聯(lián)合門診
患者只需要掛一個號,就可以實現(xiàn)一次多個科室的共同處理。優(yōu)點是常規(guī)可開展,每個星期都有這樣的單元,方便高效,但缺點是參與科室的數(shù)量不會很多。有可能無法一次完全解決問題,科室過多又有可能浪費醫(yī)療資源。目前可能適用的范圍是限定科室、已建立臨床診療路徑、具有一定數(shù)量患者的特定疾病,通過多學科聯(lián)合門診方便患者,助力規(guī)范診療。
有組織的“醫(yī)院一日游”
在患者隨診過程中,在一天之內(nèi),除有人會提前安排患者這一次去看哪些科室外,還會有志愿者在不同科室之間起到串聯(lián)作用。優(yōu)點是按照患者的需要安排,集中管理,適合長期隨診,患者體驗比較舒適、高校,但對醫(yī)院而言,這一天占用資源較多,目前實踐起來可能有一些困難。適用于對已經(jīng)確診的罕見病患者進行長期隨診管理,另外中間還需要設(shè)立一名協(xié)調(diào)員,提前溝通需求,并做好安排。
松散的多學科診療
日常診療中如患者需要轉(zhuǎn)診,目前北京協(xié)和醫(yī)院設(shè)立了門診轉(zhuǎn)診的通道,病人需要其他科室進行協(xié)同診療時,可以通過轉(zhuǎn)診通道來完成。這與目前醫(yī)生出診及診療習慣是完全兼容的,靈活多樣,可以按需解決。但是對于患者而言,仍需要輾轉(zhuǎn)各科,分別進行掛號,可能會遺漏部分???;對醫(yī)生來說也增加了工作負擔,需要充分建立好院內(nèi)罕見病診療團隊溝通機制。適用的場景則是日常診療罕見病患者,以某一科室為主,需要其他科室協(xié)同;另外適用于已經(jīng)建立罕見病多學科診療團隊、診療融入日常工作、可以定期溝通和協(xié)調(diào)的醫(yī)院。
線上虛擬MDT
優(yōu)點在于可以打破醫(yī)院界限和時空壁壘,補齊短板,同時組織更大??脐犖?,互相補位。但缺點也比較明顯,醫(yī)生無法當面接觸患者,有些科室難以實現(xiàn)查體;另外診療質(zhì)量難以保持統(tǒng)一,后續(xù)治療無法線上虛擬實現(xiàn)。適用場景可能是對醫(yī)療水平相對落后地區(qū)進行罕見病幫扶診療,對疑難罕見病可以集合各方力量的會診,組建針對某一種或某一類罕見病全國范圍內(nèi)的多學科專家團隊,定期診治疑難患者。
總而言之,以上五種方式各有利弊,需根據(jù)不同目的,結(jié)合國情實際,采取適宜的多學科管理方式或者進行聯(lián)合使用,以適應(yīng)不同的臨床需求。
2022中國罕見病大會,戴教授在報告中,通過DMD和SMA兩種常見的單基因罕見病,介紹了大數(shù)據(jù)與精準基因測序所賦能的精準醫(yī)療在神經(jīng)系統(tǒng)罕見病中的巨大潛能。個體化、精細化的基因分型不僅提供了闡明疾病機制的新證據(jù),而且為臨床醫(yī)生的治療、患者家屬的物質(zhì)與精神準備、患者預(yù)后的評估提供了有力的指導。隨著醫(yī)工結(jié)合的長遠發(fā)展,罕見病的干預(yù)與管理將邁上新臺階。
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